Obwohl die Verhandlungen über GATS, GATT und TRIPS bereits sehr viele Themen umfassen, gibt es bei der WTO noch einige Sonderformen.

Sie kommen etwa zustande, um wichtige Themen von den mehrjährigen Verhandlungsrunden abzukoppeln und möglichst schneller zu entscheiden. Teilweise kommen sie auch dadurch zustande, dass die EU für ein Thema nicht zuständig ist oder dass Verhandlungen mit Partnern außerhalb der WTO zu führen sind.

• eCommerce
• Handel und Entwicklung (z.B. Capacity Building )
• Handel und Umwelt 
• die so genannten Singapur-Themen :
  Wettbewerbspolitik
  Handel und Investitionen
  Handelserleichterungen

Im Rahmen der internen Organisation der WTO werden zudem permanent verhandelt:

• Aufnahme neuer Mitglieder
• Regionale Handelsabkommen
• Überprüfungen der Handelspolitik

Einen weiteren Sonderfall stellt dar:

• "Government Procurement"